1. 依照培養基的成分來分 培養基按其所含成分，可分為組成培養基、天然培養基和半組成培養基三類。

　　2. 依照培養基的物理情況分 培養基按其物理情況可分為固體培養基、液體培養基和半固體培養基三類。

　　3. 依照微生物的種類分 培養基按微生物的種類可分為細菌培養基、放線菌培養基、酵母菌培養基和黴菌培養基等四類。

　　4. 依照培養基用處分 培養基按其特別用處可分為加富培養基、選擇性培養基和鑒別培養基。

　　具體的：

　　(1)組成培養基。組成培養基的各種成分完全是已知的各種化學物質。這種培養基的化學成分清楚，組成成分準確，重複性強，但價格較貴，而且微生物在這類培養基中成長較慢。如高氏一號組成培養基、察氏（Czapek）培養基等。

　　(2)天然培養基。由天然物質製成，如蒸熟的馬鈴薯和一般牛肉湯，前者用於培養黴菌，後者用於培養細菌。這類培養基的化學成分很不穩定，也難以確定，但製作方便，營養豐盛，所以常被采用。

　　(3)半組成培養基。在天然有機物的基礎上恰當加入已知成分的無機鹽類，或在組成培養基的基礎上增加某些天然成分，如培養黴菌用的馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養基。這類培養基能更有效地滿意微生物對營養物質的需要。

　　常用的細菌培養基有營養肉湯和營養瓊脂培養基；常用的放線菌培養基為高氏1號培養基；常用的酵母菌培養基有馬鈴薯蔗糖培養基和麥芽汁培養基；常用的黴菌培養基有馬鈴薯蔗糖培養基、豆芽汁葡萄糖（或蔗糖）瓊脂培養基和察氏培養基等。